Deux années ont passé, Jesse est heureux avec Glenn et Annie, il espère bien revoir Willy au cours de ses vacances au bord de la mer. Willy est là, il a retrouvé sa mère, ses frère et soeur, mais n'a pas oublié Jesse. Bientôt un pétrolier s'échoue sur la côte, provoquant une marée noire dévastatrice. Les orques sont en danger!...